Nakon pristupanja u Europsku uniju, Republici Hrvatskoj na raspolaganju su strukturni instrumenti osmišljeni kao podrška ostvarivanju Kohezijske politike Europske unije:
- Europski fond za regionalni razvoj
- Europski socijalni fond
- Kohezijski fond
Središnje koordinacijsko tijelo nadležno za upravljanje ovim fondovima je Ministarstvo regionalnoga razvoja i fondova Europske unije.
Za prvih šest mjeseci članstva (od 1. srpnja 2013. do 31. prosinca 2013.) kroz navedene fondove Republici Hrvatskoj dodijeljena su sredstva u iznosu od 800 milijuna eura, od čega se 449,40 milijuna eura odnosi na fondove koji se koriste u okviru Kohezijske politike.
- Fondovi koji podupiru Zajedničku poljoprivrednu politiku te Zajedničku ribarsku politiku Europske unije:
- Europski poljoprivredni fond za ruralni razvoj
- Europski fond za ribarstvo
- Europski poljoprivredni jamstveni fond
Provedba ovih fondova je u nadležnosti Ministarstva poljoprivrede i Agencije za plaćanje u poljoprivredi, ribarstvu i ruralnom razvoju.